它是以蔗糖为原料，通过现代生物工程技术―果糖基转移酶转化、精制而成。  天然存在的和酶法生产的低聚果糖几乎都是直链状。   低聚果糖作为一种非还原性糖，其黏度、水分活度、保湿性和酸性条件下的热稳定性以及可加工性，均与蔗糖相似。

生产的低聚果糖G和P的甜度约为蔗糖的60%和30% ，它们均保持了蔗糖良好的甜味特性。  G型糖浆中低聚果糖含量为55%，蔗糖和葡萄糖及果糖含量共为45%，甜度为60%；P型粉末低聚果糖含量超过95%，甜度为30%

热稳定性较蔗糖高，在中性条件下，120℃时还非常稳定；在酸性（pH 3）条件下，温度达到70℃以后，稳定性才降低。它在一般的食品pH范围（4.0-7.0）内非常稳定，可在冷藏温度下保存一年以上。 

低聚果糖在150℃稳定，160℃开始分解。不产生美拉德变色反应。低聚果糖在中性或接近中性环境中具有相当好的热稳定性。在pH>5的环境中，加热到120℃，也比较稳定。但在pH<4的酸性环境中加热时温度超过90℃，低聚果糖将发生分解。  因此在产制酸性双歧因子食品时，例如在酸奶中添加低聚果糖时，应在原有的高温工艺后添加，并在添加后只作巴氏消毒即可入库